Za swoją działalność uhonorowany został najwyższymi polskimi orderami państwowymi, w tym w roku 2001 Krzyżem Wielkim Orderu Odrodzenia Polski, a także zagranicznymi: Krzyżem Honorowym I Klasy w dziedzinie Nauki i Sztuki Prezydenta Republiki Austrii (1991), Komandorią Orderu Zasługi Republiki Włoskiej (1999), Krzyżem Oficerskim Zakonu Kawalerów Maltańskich.

W roku 2007 otrzymał Złoty Medal Zasłużony Kulturze Gloria Artis, a w 2002 roku przyznano mu doktorat honoris causa Akademii Muzycznej im. Fryderyka Chopina w Warszawie – jego macierzystej uczelni.

Unikał poklasku

- Zmarły miał olbrzymie zasługi dla popularyzacji muzyki - powiedział Jan Popis. Znany krytyk muzyczny i producent podkreślił, że Stefan Sutkowski unikał poklasku, a najbardziej interesował go kontakt ze słuchaczem. Zdaniem Jana Popisa, szczególnym dziełem zmarłego był Festiwal Mozartowski w Warszawie. Krytyk podkreślił, że organizowany przez WOK festiwal stał się, obok festiwali w ojczyźnie kompozytora - w Wiedniu i Salzburgu, znaczącym wydarzeniem na światowym rynku muzycznym.

Założona przez zmarłego Warszawska Opera Kameralna wychowała również całe pokolenie artystów. Wśród tych, którzy odnoszą sukces na scenach całego świata, Jan Popis wymienił Olgę Pasiecznik, Martę Boberską, Dorotę Lachowicz, Roberta Gierlacha i Justynę Stępień. - Stefan Sutkowski rozumiał, że utalentowani artyści powinni dysponować sceną, na której będą mogli ten talent rozwijać - dodał Jan Popis.

Warszawska Opera Kameralna wystawia przede wszystkim dzieła muzyki dawnej. Ma w repertuarze wszystkie dzieła sceniczne Wolfganga Amadeusza Mozarta. Festiwal jego imienia organizuje od 1991 roku. Pomysłem Stefana Sutkowskiego są również festiwale Gioacchina Rossiniego, Claudia Monteverdiego, Oper Barokowych oraz Festiwal Oper Staropolskich. W Warszawskiej Operze Kameralnej wystawiane są również współczesne dzieła polskie. Stefan Sutkowski pełnił funkcję dyrektora Opery Kameralnej w latach 1961-2012.